I thought I was going to の意味とニュアンス
「I thought I was going to +動詞の原形」の意味は「~するかと思った」です。
これは「~するかと思った(けどしなかった)」というニュアンスで使われます。
I thought I was going to be late for work.
仕事に遅れるかと思った。
ポイントは「遅れるかと思ったけど遅れなかった」ことで、言葉の感覚としては日本語と同じです。
また、文脈によっては「もう少しで~するところだった」や「危うく~するところだった」とも訳されます。
FF10の例文

I thought I was going to die in this place.
「ここで死ぬかと思った」
文章的には「死んだと思ったけど死ななかった」、状況的には「危うく死にかけた」です。
そして、この「I thought I was going to die.」というフレーズ自体よく出てくるので、これを丸暗記してイメージしておくと分かりやすくなります。
映画『評決のとき』のセリフ

I thought I was gonna lose you.
君を失うのかと...(日本語字幕)
この文は「あなたを失ってしまうかと思った」という意味で、失ってはいないことは日本語と同じです。
その他の例文
I thought I was going to miss the train.
電車に乗り遅れるかと思った。
I thought I was going to spill my coffee.
危うくコーヒーをこぼしそうになった。
I thought I was going to cry when I heard the news.
そのニュースを聞いた時に泣きそうになった。
I thought I was going to see you at the party.
パーティであなたに会えるかと思ったのに。
まとめ
・「I thought I was going to」の意味は「~するかと思った」
・文脈次第で「もう少しで~するところだった」や「危うく~するところだった」とも訳せる
・「~するかと思った(けどしなかった)」というニュアンス
・ポイントは「していない」こと